A disponibilidade de programas computacionais de química
e os bancos de dados em rede são, atualmente, ferramentas fundamentais para a
descoberta e planejamento de fármacos. Estas informações permitem uma análise
rápida da atividade biológica versus propriedades físico-químicas de uma série
de moléculas de interesse. Novos agentes terapêuticos podem ser desenvolvidos
pela análise de dados teóricos de estrutura-atividade de forma tridimensional,
obtidos por técnicas recentes de modelagem molecular.
Modelagem molecular, segundo a IUPAC, é a investigação
das estruturas e das propriedades moleculares pelo uso de química computacional
e técnicas de visualização gráfica, visando fornece uma representação
tridimensional, sob um dado conjunto de circunstâncias. O planejamento de
fármacos auxiliado por computador é descrito em diversas páginas da internet e
auxilia, com tutoriais, a investigação das interações químicas de um ligante
com seu receptor e exploração dos fatores estruturais relacionados ao efeito
biológico.
Desenho e visualização tridimensional
Diversos programas de desenho de moléculas
tridimensionais são disponíveis e de fácil utilização, como ChemWindow, Isis
Draw e ChemDraw. Eles permitem a elaboração de figuras e diagramas com
qualidade e exatidão desejadas e facilitam o trabalho de documentação e
comunicação científica.
A visualização tridimensional dos fármacos é realizada
pela construção das ligações, passo a passo, no programa Chem3D.
Fármacos criado por um programa computacional:
Conversão da estrutura de sulfametoxazol em
3D, na forma de ligações cilíndricas (chemdraw - Chem3D)
Estrutura em diagrama e estrutura 3D do ácido
acetilsalicílico.
Nos programas de desenho 3D, as moléculas podem ser
representadas em uma grande diversidade de formatos, como arame, bastões,
esferas e cilindros e “Space Filling”, construídas a partir de comprimentos e
ângulos de ligação (geometria) padronizados.
Diferentes representações de sulfametoxazol,
(3a) arame, (3b) cilindro e esfera, (3c) cilindro e 3(d) "space
filling" (Chem3D)
VISUALIZAÇÃO MOLECULAR¹
VISUALIZAÇÃO MOLECULAR DE MACROMOLÉCULAS²
